NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析 （ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析 (重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘 ...

之前整理的一篇大综述 — Nature重磅综述 |关于RNA-seq，你想知道的都在这收到了热烈反响，阅读人数过万。 行文很长，最后精炼下来的文字近三万，适合深度阅读思考。 上次发出时，有读者留言说部分专业名词不理解。为了方便理解和对综述有个概览，特整理了 ...

在毒理学研究中，转录组基准浓度（BMC）建模对化学品风险评估意义重大。研究人员对比微阵列和 RNA-seq 在大麻二酚（CBC）和大麻酚（CBN）浓度响应转录组研究中的表现。结果显示二者整体基因表达模式相似，功能分析和 BMC 建模等效。该研究为转录组研究方法 ...

食管鳞癌（ESCC）占食管癌90%，早期治疗依赖内镜切除，但复发率高，缺乏特异靶向药物。液-液相分离（LLPS）在肿瘤中的作用日益受关注，但与ESCC关系不明。

开发基于RNA-seq数据和双报告器系统（IDRS）的基因组广谱终止子预测方法，在模式菌大肠杆菌和非模式菌酿酒酵母中验证了48和41个高效终止子，发现上游序列长度影响终止效率且存在跨物种兼容性，成功应用于提高丁二醇产量，为微生物工厂构建提供标准化工具 ...

得益于雷根斯堡在RNA生物学方面的专业知识、其独特的菌株库以及在培养嗜极古菌方面的专门技术，这项新技术被证明特别有效。因此，在本研究中，能够使用到最适生长温度高达113°C的超嗜热古菌世界纪录保持者。

MAPIT-seq在检测互作图谱的同时可以同步获取转录组信息，实现功能结合与表达背景的双重解析。 北京大学未来技术学院教授、核糖核酸北京研究中心研究员汪阳明团队在Nature Methods在线发表题为“Co-profiling of in situ RNA-protein interactions and transcriptome in single cells and ...

单细胞RNA测序技术的快速发展已使其能够同时处理数万乃至数十万个细胞，但面对人体约36万亿个细胞的庞大规模以及制药工业、临床研究等领域日益增长的需求，迫切需要进一步的规模化突破。多重单细胞测序技术通过预先标记不同样本，允许混合处理和测序 ...